醫藥冷庫包括壓縮機、蒸發器、冷凝器、節流裝置四大部件。醫藥冷庫制冷循環在原理上與其他循環相同。吸氣口位于壓縮機電機端部。對于雙機頭機組，來自蒸發器的制冷劑進入壓縮機吸氣口。兩個制冷劑系統各自獨立，然后制冷劑氣體均勻流過電機殼體，帶走電機熱量，進入螺桿慈和空間。螺桿相互慈和使制冷劑氣體壓縮，同時螺桿轉子頂部噴油。與壓縮過程的制冷劑混合，清潔螺桿齒和內腔內壁。
醫藥冷庫油在離心力的作用下集中在通道壁上。最終，冷劑和剩余的油流經離心通道時。從這兩局部分離進去的油集中在一次油分底部，然后流回壓縮機油槽。進入二次油分離器。二次油分離器同樣包括一個離心流道，這樣含少量油冷劑氣體流經止回閥和排氣隔離閥。后面有一個吸附分離段。油氣混合物流經這兩部分時，懸浮態的微小油滴將分離出來。
更重要的密封陰陽轉子、內腔外表之間接觸間隙，醫藥冷庫噴油不但能潤滑螺桿驅動接觸面。間隙密封良好，將減少壓縮機高低壓側之間冷劑的泄漏，因而提高壓縮機效率，壓縮完成后冷劑氣體和油得混合物從螺桿排氣端排出，進入一次油分離器。一次油分離器位于壓縮機排氣一側，由不銹鋼絲網和離心通道組成。制冷劑氣體和油的混合物流過不銹鋼絲網，流速和方向的變化，這樣局部油分離出來。
醫藥冷庫微量含油的制冷劑氣體進入冷凝器。冷凝器內的分氣板使氣流均勻掠過冷凝管束。來自冷卻塔的冷卻水災冷卻管束內流動并帶走冷凝熱。使制冷劑氣體不時過冷。
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